RS/6000機群系統(tǒng)中分子動力學并行算法的研究

在IBM RS/6000工作站組成的機群系統(tǒng)和PVM(并行虛擬機)并行環(huán)境中,用消息傳遞機制方式和C++語言實現(xiàn)了微正則系綜(NVE)的分子動力學并行計算程序,并對不同分子數(shù)(256～108000)組成的Lennard-Jones理想流體進行了模擬研究.結(jié)果表明,在小型機群系統(tǒng)中,原子分解法具有理想的加速比,考慮到區(qū)域分解法的適用范圍有限且實現(xiàn)困難,因此認為原子分解法是小型機群系統(tǒng)進行分子動力學并行模擬計算的理想選擇.

作 者： 吳江濤 劉志剛 董小社 何戈   作者單位： 吳江濤,劉志剛(西安交通大學能源與動力工程學院,陜西,西安,710049)

董小社,何戈(西安交通大學新型計算機研究所,陜西,西安,710049) 

刊 名： 工程熱物理學報  ISTIC EI PKU 英文刊名： JOURNAL OF ENGINEERING THERMOPHYSICS  年，卷(期)： 2002 23(4)  分類號： O552.3 O641.3  關鍵詞： 并行分子動力學   機群系統(tǒng)   微正則系綜   PVM并行環(huán)境  

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