瀕危植物核心種質(zhì)取樣比率的蒙特卡羅模擬研究

針對(duì)瀕危植物明黨參ISSR數(shù)據(jù)以及八角蓮和夏蠟梅的等位酶數(shù)據(jù),以多態(tài)位點(diǎn)數(shù)(A)、多態(tài)位點(diǎn)百分?jǐn)?shù)(PPB)、居群內(nèi)基因多樣度(Hs)、群體總的基因多樣度(Ht)、基因分化系數(shù)(Gst)以及捕獲的基因位點(diǎn)數(shù)為主要遺傳多樣性指標(biāo),利用蒙特卡羅模擬抽樣法在各抽樣比例下重復(fù)抽樣1000次,并構(gòu)建了3個(gè)植物群體的基因捕獲曲線與基因增量曲線.通過(guò)兩種曲線的比較分析確定這3種瀕危植物的最佳取樣比例皆為25%,但這并不意味著其他植物的最佳抽樣比也為25%.此時(shí)明黨參的多態(tài)位點(diǎn)數(shù)為163,多態(tài)位點(diǎn)百分?jǐn)?shù)為40.85%,基因多樣度為0.2744;八角蓮的多態(tài)位點(diǎn)數(shù)為12,多態(tài)位點(diǎn)百分?jǐn)?shù)為32.43%,基因雜合度為0.1943;夏蠟梅的多態(tài)位點(diǎn)數(shù)為10,多態(tài)位點(diǎn)百分?jǐn)?shù)為25%,基因雜合度為0.0638,其各項(xiàng)遺傳多樣性指標(biāo)與保護(hù)總?cè)后w95%遺傳信息的樣本非常相近.這說(shuō)明通過(guò)蒙特卡羅模擬抽樣與基因捕獲及增量曲線綜合分析確定核心種質(zhì)的最佳抽樣比例客觀合理、切實(shí)可行.

作 者： 李正宏 邱英雄 徐海明 葉倩 傅承新 LI Zheng-hong QIU Ying-xiong XU Hai-ming YE Qian FU Cheng-xin   作者單位： 李正宏,邱英雄,葉倩,傅承新,LI Zheng-hong,QIU Ying-xiong,YE Qian,FU Cheng-xin(浙江大學(xué),生命科學(xué)學(xué)院,植物系統(tǒng)進(jìn)化與生物多樣性實(shí)驗(yàn)室,浙江,杭州,310029)

徐海明,XU Hai-ming(浙江大學(xué),農(nóng)學(xué)系,浙江,杭州,310029) 

刊 名： 浙江大學(xué)學(xué)報(bào)（農(nóng)業(yè)與生命科學(xué)版）  ISTIC PKU 英文刊名： JOURNAL OF ZHEJIANG UNIVERSITY(AGRICULTURE & LIFE SCIENCES)  年，卷(期)： 2006 32(4)  分類號(hào)： Q943  關(guān)鍵詞： 蒙特卡羅模擬   取樣策略   遺傳多樣性   基因捕獲曲線   基因增量曲線  

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